تعرضت منطقة الأغوار لتغيرات سكانية واضحة تعود بالدرجة الأولى إلى سياسة التهجير والتطهير العرقي التي تمارسها سلطات الإحتلال الإسرائيلي ، ففي الفترة الممتدة بين عامي 1948 و 1967 كان يقطن منطقة الأغوار نحو 320 ألف نسمة يمتد تواجدهم من منطقة عين جدي وحتى غور بيسان شمالا .

لكن عمدت السلطات الإسرائيلية ومنذ اليوم الأول للإحتلال إلى ممارسة سياسة القتل والإرهاب لدفع الفلسطينيين إلى الهجرة .وبفعل هذه السياسة قتل المئات وهدمت عشرات التجمعات السكانية الفلسطينية ودفع سكانها إلى الهجرة إلى الجانب الأردني من الحدود .ويصل عدد التجمعات السكانية الفلسطينية التي تقطن في منطقة الأغوار حاليا إلى حوالي 24 تجمعا سكانيا ، منها مدينة واحدة هي مدينة أريحا .

وتتبع هذه التجمعات إداريا لمحافظات طوباس، نابلس، وأريحا . وينحدر معظم سكانها من من السفوح الغربية للأغوار. وكانوا يسكنون الأغوار في الشتاء لزراعة أراضيهم وفلاحتها ، ويغادرونها في الصيف بعد إنتهاء الموسم الزراعي .ويصل عدد سكان الأغوار حاليا إلى52.000 نسمة وهم من سكان المدن والفلاحين والبدو واللاجئين ، ويعتمدون في معيشتهم على العمل الزراعي بالدرجة الأولى .

أما من ناحية التضاريس والتنظيم الإداري فتقسم الأغوار إلى ثلاثة أقسام :

  1. الأغوار الشمالية : وتضم قرى بردلة ،عين البيضا ،الحمة ، الساكوت ، القاعون ، ومنطقة المالح . وتتبع إداريا لمحافظة طوباس . وينحدر معظم سكانها من مناطق الغرب مثل طوباس وطمون وتياسير حيث يشاركون السكان ملكية الأرض أيضا . وثمة جزء من هؤلاء السكان يشكلون تجمعات بدوية تأتي من جنوب الضفة .
  2. الأغوار الوسطى : وتضم قرى الجفتلك ، مرج نعجة ، الزبيدات ، مرج الغزار ،فروش بيت دجن ،النصارية ، بيت حسن ، وعين شبلي . وتتبع إداريا لمحافظتي نابلس وأريحا .وتربط السكان صلات اجتماعية وعشائرية واشتراك في ملكية الأرض مع التجمعات السكانية الواقعة في شمال الوسط الغربي مثل : طوباس ،طلوزة ،نابلس ، الفارعة، الباذان ، عقربا ، بيت فوريك ،أما باقي السكان فهم لاجئون من بئر السبع وبيسان وعجوز .
  3. الأغوار الجنوبية : ويتبع سكانها إداريا لمدينة أريحا بينما ينحدر أصحاب الأراضي وملاكها من مناطق عقربا ، رام الله ، القدس ، وبيت لحم . وتصنف 80 % من أراضي المنطقة  بأنها أملاك دولة .

أ . مناطق العوجا وفصايل : غالبية سكان فصايل هم من اللاجئين ، بينما تنتمي غالبية سكان العوجا إلى العشائر التي سكنت المنطقة منذ مئات السنين (عشائر النجوم ، الجهالين ، والعابنه والمليحات وطريفات العامرين).

ب. منطقة أريحا : وتضم مدينة أريحا ،وفرية الديوك ،والنويعمه ،وعين السلطان . ومعظم سكان هذه المنطقة هم من اللاجئين بإستثناء الرياحنه الذين يعتبرون من السكان الأصليين ويشكلون حوالي 40 % .

ج. منطقة الخان الأحمر ، النبي موسى ، ووادي القلط ،وهي منطقة تجمع بدوي ولا يوجد فيها مجال للزراعة النباتية .

ويبين الجدول التالي إحصاء بأعداد السكان في أبرز التجمعات السكانية في منطقة الأغوار حسب موقع السكن :

1. عدد سكان الأغوار في المناطق التابعة لمنطقة طوباس حسب التجمع 2006-2010

اسم التجمع

عدد السكان في منتصف العام

2006

2007

2008

2009

2010

بردلة

1.577

1.626

1.675

1.724

1.773

عين البيضا

1.081

1.114

1.148

1.182

1.215

كردلة

165

170

176

181

186

الفارسية

213

220

226

233

240

المالح

206

213

219

226

232

الحديدية

183

189

194

200

206

    

2. عدد سكان الأغوار في المناطق التابعة لمحافظة نابلس حسب التجمع 2006-2010

اسم التجمع

عدد السكان في منتصف العام

2006

2007

2008

2009

2010

عين شبلي

198

204

209

215

220

بيت حسن

1.192

1.226

1.259

1.293

1,326

النصارية

1.354

1.392

1.430

1.468

1.506

العقربانيه

895

920

946

971

996

فروش بيت دجن

1.159

1.191

1.224

1.256

1.289

 3.عدد سكان الأغوار في المناطق التابعة لمحافظة أريحا 

اسم التجمع

عدد السكان في منتصف العام

2006

2007

2008

2009

2010

مرج نعجة

767

791

814

838

861

الزبيدات

1.340

1.382

1.423

1.464

1.504

مرج الغزال

385

397

409

420

432

الجفتلك

4.401

4.536

4.671

4.805

4.939

فصايل

900

928

955

983

1.010

العوجا

4.010

4.133

4.256

4.379

4.501

النويعمة

1.165

1.200

1.236

1.272

1.307

عين الديوك الفوقا

814

839

864

889

914

عين الديوك التحتا

967

996

1.026

1.055

1.085

أريحا

20.416

21.044

21.669

22.293

22.915

مخيم عقبة جبر

6.343

6.538

6.733

6.926

7.120

مخيم عين السلطان

2.036

2.098

2.160

2.223

2.285

تجمعات أخرى

76

79

81

83

85

مجموع السكان في مختلف مناطق السكن

51.853

53.426

55.003

56.579

58.147

ملاحظة: الإحصائيات السابقة لا تشمل التجمعات البدوية في منطقة الأغوار